Applied Computational Genomics - 06 - SAM, BAM, CRAM format.
Aaron Quinlan · 71:51 · Watch on YouTube
이 게노믹스/생물정보학 과정의 강의는 FASTQ 파일에서 시작하는 시퀀싱 리드가 BWA-MEM을 사용하여 정렬된 리드로 어떻게 변환되고, 그 결과가 SAM/BAM/CRAM 형식으로 어떻게 저장되는지 설명합니다. 각 SAM 필드의 의미(특히 CIGAR 문자열과 비트 압축된 FLAG), samtools가 정렬을 어떻게 변환하고 정렬하고 인덱싱하여 IGV 같은 도구로 표시할 수 있게 하는지를...